Mihael je otroška leta preživljal v okolju Tepanjskega Vrha. Prve tri razrede ljudske šole je obiskoval v Slovenskih Konjicah, kjer je pokazal veliko nadarjenost in željo po znanju. Starša sta ga sklenila poslati v šolo v Celje. Napotnik je v Celju končal četrti razred ljudske šole in nato še gimnazijo. Leta 1872 je vstopil v bogoslovje v Mariboru. Doštudiral je z odličnim uspehom in bil 25. julija 1875 posvečen v duhovnika. Novo mašo je imel v Slovenskih Konjicah. Kot duhovnik je kasneje služboval v Vojniku, Sevnici in Mariboru. V letih 1885−1889 je bil dvorni kaplan na Dunaju ter študijski direktor, bibliotekar in ekonom Frintaneja na Dunaju. Leta 1889 je bil imenovan za lavantinskega škofa, kar je ostal do smrti. V prizadevanju za reorganizacijo škofije je vodil pet škofijskih sinod, s katerimi je položil temelje učinkovitejši pastoralni dejavnosti lavantinskih duhovnikov.
Boldin, A. Dr. Mihael Napotnik, lavantinski škof. Slovenske Konjice: Občina: Nadžupnija, 2009.
Konjiško: 850 let pražupnije: 1146-1996. Slovenske Konjice: Nadžupnijski urad, 1996.
Stegenšek, A. Umetniški spomeniki Lavantinske škofije. Zv. 2, Konjiška dekanija: s 75 nariski v tekstu in 94 slikami na 59 tablicah. V Mariboru: pisatelj, 1909.