Rojen je bil v kmečki družini pod Lipo v Prekmurju. Po maturi na Gimnaziji v Murski Soboti leta 1961 je izobraževanje nadaljeval s študijem na Medicinski fakulteti v Ljubljani. Po končanem izobraževanju 1966 se je vpisal na specializacijo iz nevropsihiatrije v Ljubljani, specialist pa je postal v Zagrebu leta 1971. Januarja 1972 se je odločil karierno pot nadaljevati v Švici. Tam je delal v treh psihiatričnih bolnišnicah in opravil študij na Inštitutu Carla Gustava Junga v Zürichu. Diplomo psihoanalitika je pridobil konec leta 1975. Nato se je naslednje leto preselil v Nemčijo, kjer je delal kot psihiater in psihoterapevt ter na področju sodne medicine. Doktoriral je leta 1978 v Tübingenu. Po letih v tujini se je 1983 vrnil v domovino. Delal je v psihiatričnih bolnicah, najprej v Mariboru, potem v Ormožu, v Zdravstvenem domu Murska Sobota in nazadnje v lastni psihiatrični ordinaciji v Rakičanu. Bil je predavatelj, mentor in supervizor za psihoanalizo v okviru Mednarodne zveze za analitično psihologijo, od 2001 do 2003 tudi v Beogradu, sedaj pa le v Ljubljani.
Na svoji življenjski poti se je preizkusil tudi v politiki, bil je član Skupščine Republike Slovenije, član Državnega sveta Republike Slovenije in član Skupščine občine Murska Sobota.
Senčar, E. Verjamem v individualno ustvarjalnost: psihiater Jožef Magdič. Nedelo, 14. jul. 2013, let. 19, št. 28, str. 15. Dostopno tudi na naslovu: Psihiater Jožef Magdič: Verjamem v individualno ustvarjalnost (delo.si) (citirano 7. 4. 2023)
Toš, V. Edina prava zaobljuba je bolj ceniti sebe. Vestnik, 10. jan. 2019, let. 71, št. 2, str. 16 – 17. Dostopno tudi na naslovu: Edina prava zaobljuba je bolj ceniti sebe – Vestnik.si.(citirano 7. 4. 2023)
Langner Von Höveling, B. Uporniški duh v njem je še živ. Nevropsihiater Jože Magdič je bil vedno upornik in nemirnega duha, zato se je moral večkrat seliti in tudi večkrat začeti znova. Pen: mesečnik, 30. mar. 2023, št. 3, str. 10 – 11.
Ustni vir: Jožef Magdič, pogovor o sanjski življenjski poti ob okrogli obletnici, Beltinci, 2. mar. 2023.