Rojen je bil 30. septembra 1934 v Šentjerneju očetu Vladimirju Kovačiču in materi Lidiji roj. Golar. Oče je bil upravnik tamkajšnje šole, mati pa učiteljica. Šolo je najprej obiskoval v Šentjerneju, po letu 1947 pa v Kranju, od koder izvira očetova družina. Po maturi na kranjski gimnaziji leta 1954 je šel študirat farmacijo v Zagreb, kjer je diplomiral leta 1962.
Po diplomi je Kovačič kariero začel kot farmacevt v lekarni v Kranju, kmalu zatem pa se je zaposlil v podjetju Farmis v Ljubljani, ki je takrat združevalo Lek in Krko. V novomeški tovarni zdravil Krka se je zaposlil leta 1964, kjer je bil najprej dvajset let komercialni direktor. Leta 1985 je nasledil dotedanjega direktorja Krke Borisa Andrijaniča, bil najprej imenovan za predsednika poslovodnega odbora, štiri leta pozneje pa za generalnega direktorja Krke. Krko je vodil do leta 2004, ko je zasedel mesto svetovalca uprave, vodilno mesto pa je prevzel njegov dolgoletni namestnik Jože Colarič. Upokojil se je konec leta 2005.
Leta 1962 je postal predsednik društva slovenskih farmacevtov, dve leti pozneje pa tudi predsednik jugoslovanske zveze farmacevtov.
Zavzemal se je za na modernizacijo podjetja, na raziskovalno in razvojno delo ter na uvajanje sodobnih tehnologij in razvoj kadrov. Po razpadu Jugoslavije je Krka pod njegovim vodstvom prešla na lastno proizvodnjo generičnih zdravil in močno razširila tržišče na Poljsko in Rusijo, kjer je odprla tudi svoji tovarni.
Kovačič je prejel več nagrad s področja gospodarstva in bil večkrat (1997, 1998, 2000) razglašen za najuspešnejšega slovenskega direktorja. Bil je prejemnik častnega znaka svobode Republike Slovenije za delo in zasluge v slovenskem gospodarstvu. Od leta 2003 je bil tudi častni konzul Poljske v Sloveniji, leta 2004 pa mu je ruski predsednik Vladimir Putin podelil »orden prijateljstva« za zasluge pri krepitvi gospodarskih in prijateljskih vezi med Rusijo in Slovenijo.
Leta 2005 je v knjižni obliki izšla njegova biografija z naslovom Trgovec z življenjem, kjer je na iskriv način opisana njegova življenjska in poklicna pot.
Bil je častni občan občin Novo mesto, Šentjernej, Kostanjevica na Krki in Škocjan.
Umrl je 17. februarja 2016 v Ljubljani.
Nagrada Gospodarske zbornice Slovenije za izjemne gospodarske dosežke, 1991
Minařikovo odličje, 1991
Priznanje Združenja Manager za življenjsko delo za izjemne dosežke na področju menedžmenta, 2004
Dolenjski list, 14. oktober 2004 št. 41, str. 24 – s sliko.
Enciklopedija Slovenije 5, str. 340 (podatek, da je postal generalni direktor l. 1989).
https://www.dnevnik.si/1042730231/posel/novice/milos-kovacic-dolgoletni-predsednik-uprave-in-generalni-direktor-krke-1