Rodil se je materi Mariji Andrejc in očetu Alojzu na Koroškem. Prve štiri razrede osnovne šole je zaključil v Šmiklavžu, nato je šolanje nadaljeval v Slovenj Gradcu, gimnazijo pa v Velenju. Leta 1973 je diplomiral na AGRFT v Ljubljani (smer gledališka in radijska režija) z diplomsko predstavo Janeza Žmavca Podstrešje. Še istega leta se je zaposlil v Primorskem dramskem gledališču Nova Gorica kot vodja Mladinskega odra. Od leta 1973 je bil programski vodja Goriških srečanj malih odrov. Njegova je tudi zamisel koncepta in izvedba Srečanja gledališč Alpe Jadran od leta 1984-1987.
Amaterski mladinski oder je mladinska gledališka skupina, ki jo je neprekinjeno od ustanovitve leta 1977 v sklopu gledališča v Novi Gorici vodil režiser Emil Aberšek. Letno so pripravili vsaj po eno predstavo iz širokega spektra uprizoritev: predstave za otroke, za mladino, za odrasle, muzikale, ki vabijo k razmisleku o socialnih vprašanjih brez stereotipov ali pedagoške demagogije. Velikokrat gre za premiere po scenariju režiserja samega, z lastno glasbo in s soudeležbo profesionalnih igralcev, lektorjev, šivilj, maskerk, lučnih mojstrov in drugih. Ta edinstvena kombinacija profesionalnega z ljubiteljskim v slovenskem prostoru je skupaj z mentorjevim pretanjenim občutkom za odraščajočo populacijo dala krila številnim nadarjenim mladim, ki so umetniški zagon preobrazili v poklic.
Režiser Aberšek je neprestano sodeloval z ljubiteljskimi skupinami na Goriškem in v zamejstvu kot avtor iger in režiser. Bil je programski vodja in organizator gledaliških abonmajev za otroke in mladino v Slovenskem narodnem gledališču v Novi Gorici. Za predstavo Podstrešje so mu leta 1973 podelili Prešernovo nagrado in skupinsko Borštnikovo priznanje. Javni sklad Republike Slovenije za kulturne dejavnosti mu je 25. januarja 2017 podelil srebrno plaketo za dolgoletno delo na področju gledališke ustvarjalnosti, vzgoje in izobraževanja mladih ter kulturnega sodelovanja s Slovenci v zamejstvu.
Režija (izbor):
Emil Aberšek: Sedem na en mah, PDG Nova Gorica, 1986
Alojz Gradnik: Poslednji gost, PDG Nova Gorica, 1982
Jože Snoj, Emil Aberšek: Avtomoto mravlje, SNG Nova Gorica, 1979
Svetlana Makarovič: Sapramiška, SNG Nova Gorica, 1978
Franček Rudolf: Lenega čaka dolgčas, SNG Nova Gorica, 1977
Klaus Eidam: Ostržkove dogodivščine, SNG Nova Gorica, 1974
France Bevk: V kaverni, SNG Nova Gorica, 1974
Danilo Gorinšek: Rdeča kapica, SNG Nova Gorica, 1973
Janez Žmavc: Podstrešje, AGRFT Ljubljana, 1973
Dramaturgija (izbor):
Novak: Gugalnik, SNG Nova Gorica, 1978
Scenografija (izbor):
Jože Snoj, Emil Aberšek: Avtomoto mravlje, SNG Nova Gorica, 1979
Slovenska biografija
Dnevnik (prispevek)
RTV (prispevek)
Dnevnik (prispevek)
Primorske novice (intervju)
Delo (prispevek)
JSKD (prispevek)
Jug, A. Gledališče na vrvici vzbuja v mladih ljubezen do odrskega nastopanja. Primorski dnevnik, 24. marec 2005, leto 61, št. 70, str. 16.
Koršič, I. Pomembni mejniki na razvejeni režijski poti. Novi glas, 6. november 2023, leto 8, št. 42, str. 3.
Osebnosti: veliki slovenski biografski leksikon: prva knjiga: od A do L. Ljubljana: Mladinska knjiga, 2008, str. 1.
Primorski slovenski biografski leksikon: 18. snopič. Gorica, 1992, str. 427-428.
Remiaš, M. Služba kot sreča, sreča kot življenje, življenje kot gledališče, gledališče kot ženska: Emil Aberšek, goriški gledališki kariatidek. Oko: tednik za Goriško, 29. april. 1994, št. 14, str. 14.
Slovensko narodno gledališče Nova Gorica. Gledališki list. 2014/2015, leto 60, št. 3, str. 42-49.
Vesela Goriška: zbornik o ljubiteljski kulturi. Nova Gorica, 2019, str. 152-153.
Sandra Simoniti. ABERŠEK , Emilijan (Emil). (-). Obrazi slovenskih pokrajin. Mestna knjižnica Kranj, 2020. (citirano: 28. 11. 2023) Dostopno na naslovu: https://www.obrazislovenskihpokrajin.si/?post_type=oseba&p=34703